Načelo izolatorjev iz kaljenega stekla

Nekateri ojačevalci se nahajajo navzgor od promotorja, drugi pa navzdol, tako da učinek izolatorja ni odvisen od njegovega relativnega položaja glede na promotor. Zato razlog za usmerjenost učinka izolatorja še ni popolnoma razumljen. Trenutno je bilo ugotovljeno, da dva lokusa vplivata na funkcijo izolatorja s trans-aktivacijo. Gen S2J(Hw) kodira nukleoprotein, ki prepozna izolatorje; izolator začne svoj izolacijski učinek šele po vezavi nanj. Ko ta gen mutira, čeprav je v lokus y vstavljen izolator, se izolacijski učinek izgubi in y se izraža v vseh tkivih. Drugi lokus je mod(mdg 4) in mutacije v tem genu imajo nasprotni učinek kot Su(Hw); vsi ti mutanti povečajo izolacijski učinek, zaradi česar izolacijski učinek izolatorja ni več usmerjen, temveč razširjen, s čimer blokira učinke gorvodnih in spodnjih ojačevalcev. Ena od razlag je, da se Su(Hw) najprej veže na DNA izolatorja, kar daje izolatorju njegov izolacijski učinek. Ko se mod(mdg4) združi s Su(Hw), izolator izgubi svoj izolacijski učinek; ko se mod(mdg4) nenadoma spremeni, se ne more združiti s Su(Hw), zato se izolacijski učinek izolatorja ponovno poveča.